Atelier The Virtual Brain Node 5

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L’atelier est consacré à une compréhension théorique et pratique de la modélisation des réseaux cérébraux à grande échelle en utilisant la plate-forme neuroinformatique ‘open source’ The Virtual Brain (TVB). Pour la première fois, cet atelier se tiendra au cours de 2 jours et aura des séances pratiques de modélisation avec des cas d’utilisation concrets : étude de l’état de repos et des applications cliniques à l’épilepsie et aux accidents vasculaires cérébraux. Nous proposons également, pour la première fois, une formation approfondie de l’adaptation des modèles de cerveau virtuel aux données d’imagerie humaine.

Cet environnement de simulation de cerveau virtuel permet la modélisation biologiquement réaliste de la dynamique du réseau en utilisant des approches basées sur le connectome à travers différentes échelles cérébrales. Les modèles personnalisés de réseaux neuronaux peuvent être dérivés à partir des données IRM individuelles. Ces modèles du réseau cérébral sont configurables et génèrent des signaux macroscopiques de neuroimagerie, tels que les IRMf, les EEG stéréotaxiques et intracrâniens, ainsi que les EEG et MEG de surface de sujets individuels. Grace au TVB, les chercheurs de différentes disciplines peuvent ainsi bénéficier d’une plateforme logicielle intégrative incluant un système de soutien pour la gestion des données (génération, organisation, stockage, intégration et partage) et un noyau de simulation écrit en Python.

Format : présentations et tutoriels pratiques. Les participants sont encouragés à apporter leurs propres données pour travailler.

Aperçu du programme :

  • Introduction théorique sur la modélisation des réseaux cérébraux à grande échelle
  • Architecture de The Virtual Brain
  • Intéragir avec TVB en utilisant les interfaces GUI et Python
  • Pré-traitement des données d’imagerie, ou comment obtenir un set de données TVB
  • Ajustement des paramètres des modèles aux données fonctionnelles
  • Modélisation des réseaux neuronaux à l’état de repos dans les IRMf
  • Modélisation d’un accident vasculaire cérébral et de sa récupération
  • Modélisation de l’épilepsie et des interventions chirurgicales
  • Modification du code TVB et implémentation de nouvelles fonctionnalités
  • Sessions pratiques avec vos propres données: pré-traitement et simulations

Informations et inscription

Date limite d’inscription : 20 avril 2017

Pour toute question, veuillez contacter Viktor Sip.

Atelier
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